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50 复旦大学 哲学、政治学、中国语言文学、中国史、数学、物理学、化学、生物学、生态学、材料科学与工程、环境科学与工程、基础医学、临床医学、中西医结合、药学、机械及航空航天和制造工程、现代语言学
51 同济大学 建筑学、土木工程、测绘科学与技术、环境科学与工程、城乡规划学、风景园林学、艺术与设计
52 上海交通大学 数学、化学、生物学、机械工程、材料科学与工程、信息与通信工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、土木工程、化学工程与技术、船舶与海洋工程、基础医学、临床医学、口腔医学、药学、电子电气工程、商业与管理
53 华东理工大学 化学、材料科学与工程、化学工程与技术
54 东华大学 纺织科学与工程
55 上海海洋大学 水产
56 上海中医药大学 中医学、中药学
57 华东师范大学 教育学、生态学、统计学
58 上海外国语大学 外国语言文学
59 上海财经大学 统计学
60 上海体育学院 体育学


学科建设

学校是国家教育部“人才培养模式创新实验区”和“特色专业点”建设高校。学校有“双一流”建设学科2个,国家重点学科4个,国家重点学科(培育)2个,“双一流“建设学科数和国家重点学科数均居全国中医院校第二、上海市地方高校之首;有国家中医药管理局中医药重点学科38个,上海市重点学科(上海高校一流学科)10个;有3个一级学科博士学位授予点,1个专业博士学位授予点,24个二级学科博士学位授予点;有6个一级学科硕士学位授权点,5个专业硕士学位授予点,35个二级学科硕士学位授权点,3个博士后科研流动站,博士学位授予专业覆盖全部中医药学科。
在2010年的全国博士后科研流动站评估中,学校中药学学科被评为全国唯一的中药学一级学科“优秀”流动站,也是唯一荣获“全国优秀博士后科研流动站”称号的上海市属高校。在2012年教育部第三轮学科评估中,学校中药学一级学科排名全国第一,中医学一级学科排名全国第二,中西医结合一级学科排名全国第三。近年,有1篇博士论文被评为“全国优秀博士论文”,4篇博士论文获“全国优秀博士论文”提名。
2017年12月28日,教育部学位与研究生教育发展中心公布了全国第四轮学科评估结果。学校中医学、中药学、中西医结合三个学科携手参评,均取得A+的优秀成绩,是全国中医院校中唯一取得3个A+的高校。
博士后科研流动站(3个):中医学、中西医结合医学、中药学 
一级学科博士学位授权点(3个):中医学、中西医结合医学、中药学
博士专业学位授权点(1个):中医
一级学科硕士学位授权点(6个):中医学、中西医结合医学、中药学、药学、医学技术、科学技术史 
硕士专业学位授权点(5个):中医、中药学、护理、翻译、公共卫生
“双一流”建设学科(2个):中医学、中药学 
国家重点学科(4个):中医外科、中药学、中医内科、中医骨伤科学 
国家重点(培育)学科(2个):中医医史文献学、针灸推拿学 
国家中医药管理局中医药重点学科(38个):药用植物学、中医诊断学、中医各家学说、中医药工程学、中医肝胆病学、中医传染病学、中医肾病学、中医肿瘤病学、中医肛肠病学、中医骨伤科学、中西医结合临床、针灸学、推拿学、古汉语与医古文、内经学、中西医结合基础、中医基础理论、中医复杂科学、中医史学、中医文化学、中医文献学、中医痹病学、中医疮疡病学、中医护理学、中医急诊学、中医乳腺病学、中医养生学、中西医结合临床、中医全科医学、中西医结合临床、中医护理学、中医药信息学、中医“治未病”学、中医康复学、中医皮肤病学、中医血液病学、中医儿科学、中医神志病学 
上海市“重中之重”学科(1个):中药学 
上海市重点学科(9个):中医妇科学、中医诊断学、中医系统实验方剂学、中医医史文献、中药学、针灸推拿学、中医骨伤科学、中医外科学、中医内科学 
上海高校一流学科(6个):A类-中药学;B类-中医学、中西医结合、科学技术史;培育-护理学、药学 
上海高校高峰高原学科:I类高峰-中药学、II类高峰-中医学、I类高原-中西医结合、科学技术史
上海市教育委员会重点学科(5个):中药临床药理学、中药药剂学、中医诊断学、中医脾胃病学、中西医结合基础
ESI全球前1%学科(2个):临床医学、药理学与毒理学
 

教学建设

截至2018年5月,学校设有16个本科专业,除中医学、中药学、中西医临床本科专业外,还设有护理学、食品卫生与营养学、康复治疗学、药学、生物医学工程、预防医学等专业。学校还有8个继续教育的本、专科专业。学校建有国家级精品课程7门,国家级特色专业建设点3个,国家级精品课程7门,国家级实验教学示范中心3个,国家级精品视频公开课4门,国家级教学成果奖6项,上海市精品课程39门,国家级来华留学英文授课品牌课程1门,上海市来华留学生英语授课示范性课程6门,上海市全英语示范课程3门,上海市教学成果奖23项,上海市教育科学研究成果奖6项。学校获得包括特等奖、一等奖在内的多项国家级教学成果奖。学校拥有国家级人才培养模式创新实验区项目1个,上海市高地建设项目5个,上海市实验教学示范中心1个。
1999年,学校首批通过了教育部“本科教学工作优秀学校”的评估,2007年在本科教学工作水平评估中获得“优秀”结论。
国家教育部“人才培养模式创新实验区”:中医药创新人才培养模式实验区
国家教学成果奖(6项):我国临床医学教育综合改革的探索和创新——“5+3”模式的构建与实践(特等奖主要完成单位),“文化引领,追求卓越”——医学院教师发展中心的探索与实践(一等奖),中医人才培养模式的研究与实践、始终坚持“以学生为中心、继承与创新并重”的高等中医药教育教学改革、《实验中医学》课程建设、中医解剖学新学科创建与发展(二等奖4项) 
国家级实验教学示范中心(3个):中医学国家级实验教学示范中心、中药学国家级实验教学示范中心、中医药国家级虚拟仿真实验教学中心 
国家首批精品在线开放课程:中医骨伤科学 
国家级精品课程(7个):中医诊断学、中医内科学、内经选读、中医外科、医古文、实验中医学、针灸学
国家级视频公开课(4个):走进经络的世界、从中医学看什么是好的医学、走近中药、随处可见的筋骨操作
国家级来华留学生全英语授课品牌课程(1个):推拿治疗学
国家级特色专业建设点(2个):中医学(第一批)、中药学(第三批) 
上海市精品课程(24个):推拿手法学、中药学、护理学基础、医患沟通理论与实践、传统保健体育、运动与中医、康复医学、腧穴解剖学、中国医学史、 药用植物学、中医基础理论、推拿学、中医英语、伤寒论、中药药理学、中医基础综合实验、中医妇科学、中医诊断学、中医外科学、内经选读、方剂学、医古文、实验中医学、针灸学 
上海市第十届教育科学研究成果一等奖:高等中医药教育人才培养评价体系及质量预警信息系统研究 

上海中医药大学考研专业目录:

基础医学院

针灸推拿学院

气功研究所

科技实验中心

中药学院

中药研究所

外语中心

上海中医药大学附属龙华医院

上海中医药大学附属曙光医院

上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院

上海中医药大学附属市中医医院

上海中医药大学附属普陀医院

长海医院

市第六人民医院

上海中医药大学附属市中西医结合医院

上海中医药大学附属光华医院

苏州市中医院

护理学院

香山中医院

康复医学院

上海中医药大学附属第七人民医院

温岭市中医院 上海中医药大学附属曙光医院宝山分院

公共健康学院

交叉科学研究院

科技人文研究院

中医健康协同创新中心

天山中医医院

上海健康医学院

创新中药研究院

上海市肺科医院