新疆医科大学医学工程技术学院成立于2003年3月，现有教职工55人，专任教师36人，其中教授4人、副教授16人；博士（后）9人；博士生导师1人、硕士生导师11人，“天山学者”1人，“自治区高层次人才引进工程”项目1人，自治区“天山英才”计划3人。学院两个教学实验中心总面积3315平米，设备总值1200多万元。
近三年学院主持各级各类科研课题65项，其中国家级10项，省部级18项，科研经费共计660余万元。发表SCI、EI等期刊收录论文40余篇，中文核心期刊论文60余篇。
学院坚持“医工结合”的发展思路，承办信息管理与信息系统、生物医学工程两个专业。已累计向社会输送管理学和工学专业人才500多人，毕业生已逐步成长为业务骨干，得到用人单位的肯定。近三年的毕业生就业率均为100%。
学院实行本科生全程导师制，积极开展第二课堂、创新创业教育活动，组织学生开展各类学术科技竞赛，每年获得数十项全国和自治区奖项，激发了学生的学习主动性和创新意识。学院先后与国内外多所院校开展了广泛的学术合作交流并建立战略伙伴关系，有力地促进了教学科研水平的提高。