全国各大学生理学专业排名是对学校该学科专业教学科研能力的相对实力评估，生理学专业的全国排名反映了本专业在全国开设该专业的学校中的排名情况，此排名根据教育部2015年发布的全国高校学科评估专业排行榜报告得出，通过排名可以反映出生理学专业学校的师资力量、科研成果、就业前景，一般研究生专业排名靠前的专业无论在学术发展还是就业上都有更多的优势，但同时考研的竞争也更激烈，相对来说更难考取。专业排名靠后的专业实力一般但相对竞争更小考取更容易。
2007年生理学专业全国排名
| 排名 | 学校名称 | 等级 | 排名 | 学校名称 | 等级 | 排名 | 学校名称 | 等级 |
| 1 | 北京大学 | A+ | 5 | 浙江大学 | A | 9 | 中山大学 | A |
| 2 | 中国农业大学 | A+ | 6 | 山西医科大学 | A | 10 | 河北医科大学 | A |
| 3 | 复旦大学 | A+ | 7 | 华东师范大学 | A | 11 | 哈尔滨医科大学 | A |
| 4 | 中南大学 | A | 8 | 华中科技大学 | A | 12 | 大连医科大学 | A |
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B+等(19个)：青岛大学、首都医科大学、东北师范大学、南京医科大学、上海交通大学、武汉大学、中国医科大学、西安交通大学、延边大学、华中农业大学、四川大学、吉林大学、广西医科大学、北京师范大学、山东大学、福建医科大学、东北林业大学、西北农林科技大学、华南师范大学 |
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B等(19个)：武汉科技大学、重庆医科大学、昆明医学院、石河子大学、南京大学、安徽医科大学、辽宁医学院、泸州医学院、新疆医科大学、内蒙古医学院、南华大学、兰州大学、南方医科大学、汕头大学、清华大学、江苏大学、潍坊医学院、暨南大学、温州医学院 |
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C等(13个)：名单略 |
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2015-2016年生理学专业全国排名
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| 1 | 北京大学 | 5★ | 113 |
| 2 | 南京大学 | 5★ | 113 |
| 3 | 复旦大学 | 5★ | 113 |
| 4 | 中山大学 | 5★ | 113 |
| 5 | 厦门大学 | 5★ | 113 |
| 6 | 武汉大学 | 5★ | 113 |
| 7 | 北京协和医学院 | 4★ | 113 |
| 8 | 中国农业大学 | 4★ | 113 |
| 9 | 西安交通大学 | 4★ | 113 |
| 10 | 山西医科大学 | 4★ | 113 |
| 11 | 华中农业大学 | 4★ | 113 |
| 12 | 上海交通大学 | 4★ | 113 |
| 13 | 青岛大学 | 4★ | 113 |
| 14 | 四川大学 | 4★ | 113 |
| 15 | 浙江大学 | 4★ | 113 |
| 16 | 西北农林科技大学 | 4★ | 113 |
| 17 | 南方医科大学 | 4★ | 113 |
| 18 | 山东大学 | 4★ | 113 |
| 19 | 首都医科大学 | 4★ | 113 |
| 20 | 南昌大学 | 4★ | 113 |