与社会科学相比，自然科学研究生在毕业人数方面占有优势。据国务院学位办公室发表的统计数据，我国大学2013年授予的自然科学博士占博士总数的71.05%，授予的自然科学硕士占硕士总数的55.92%。
另对中国大学公布的2007~2012年招生的博士生导师资料统计，自然科学博导占博导总数的73.42%。
自然科学共有72个一级学科。有273所大学有自然科学博士学位授予权，434所大学有自然科学硕士学位授予权。
自然科学是人类认识和改造物质世界的科学，一个国家的自然科学水平决定了这个国家认识和改造物质世界的能力。
2015中国大学研究生院自然科学100强(B级及其以下相同等级排名不分先后)
| 排名 | 等级 | 校名 |
| 1 | A++ | 浙江大学 |
| 2 | A++ | 清华大学 |
| 3 | A++ | 北京大学 |
| 4 | A++ | 上海交通大学 |
| 5 | A++ | 复旦大学 |
| 6 | A++ | 南京大学 |
| 7 | A++ | 四川大学 |
| 8 | A++ | 哈尔滨工业大学 |
| 9 | A++ | 华中科技大学 |
| 10 | A+ | 中山大学 |
| 11 | A+ | 山东大学 |
| 12 | A+ | 中国科学技术大学 |
| 13 | A+ | 吉林大学 |
| 14 | A+ | 武汉大学 |
| 15 | A+ | 西安交通大学 |
| 16 | A+ | 中南大学 |
| 17 | A+ | 东南大学 |
| 18 | A+ | 北京航空航天大学 |
| 19 | A+ | 天津大学 |
| 20 | A+ | 大连理工大学 |
| 21 | A+ | 华南理工大学 |
| 22 | A+ | 同济大学 |
| 23 | A | 兰州大学 |
| 24 | A | 西北工业大学 |
| 25 | A | 南开大学 |
| 26 | A | 北京理工大学 |
| 27 | A | 华东理工大学 |
| 28 | A | 中国农业大学 |
| 29 | A | 重庆大学 |
| 30 | A | 苏州大学 |
| 31 | A | 厦门大学 |
| 32 | A | 南京航空航天大学 |
| 33 | A | 湖南大学 |
| 34 | A | 电子科技大学 |
| 35 | A | 北京师范大学 |
| 36 | A | 南京理工大学 |
| 37 | A | 西安电子科技大学 |
| 38 | A | 华东师范大学 |
| 39 | A | 南京农业大学 |
| 40 | A | 首都医科大学 |
| 41 | A | 北京化工大学 |
| 42 | A | 江南大学 |
| 43 | A | 北京科技大学 |
| 44 | A | 东北大学 |
| 45 | B+ | 西北农林科技大学 |
| 46 | B+ | 江苏大学 |
| 47 | B+ | 哈尔滨工程大学 |
| 48 | B+ | 东华大学 |
| 49 | B+ | 北京工业大学 |
| 50 | B+ | 华中农业大学 |
| 51 | B+ | 上海大学 |
| 52 | B+ | 武汉理工大学 |
| 53 | B+ | 郑州大学 |
| 54 | B+ | 中国海洋大学 |
| 55 | B+ | 西南交通大学 |
| 56 | B+ | 南京医科大学 |
| 57 | B+ | 北京交通大学 |
| 58 | B+ | 浙江工业大学 |
| 59 | B+ | 西南大学 |
| 60 | B+ | 东北师范大学 |
| 61 | B+ | 中国医科大学 |
| 62 | B+ | 南京工业大学 |
| 63 | B+ | 福州大学 |
| 64 | B+ | 河海大学 |
| 65 | B+ | 南昌大学 |
| 66 | B+ | 北京邮电大学 |
| 67 | B+ | 中国矿业大学 |
| 68 | B+ | 华中师范大学 |
| 69 | B+ | 燕山大学 |
| 70 | B+ | 扬州大学 |
| 71 | B+ | 华南农业大学 |
| 72 | B+ | 合肥工业大学 |
| 73 | B+ | 重庆医科大学 |
| 74 | B+ | 哈尔滨医科大学 |
| 75 | B+ | 暨南大学 |
| 76 | B+ | 南方医科大学 |
| 77 | B+ | 陕西师范大学 |
| 78 | B+ | 西北大学 |
| 79 | B+ | 中国石油大学(北京) |
| 80 | B+ | 华北电力大学 |
| 81 | B+ | 中国石油大学(华东) |
| 82 | B+ | 中国药科大学 |
| 83 | B+ | 中国地质大学(北京) |
| 84 | B+ | 天津医科大学 |
| 85 | B+ | 昆明理工大学 |
| 86 | B+ | 华南师范大学 |
| 87 | B+ | 南京师范大学 |
| B | 中国地质大学(武汉) | |
| B | 山东农业大学 | |
| B | 四川农业大学 | |
| B | 东北林业大学 | |
| B | 北京林业大学 | |
| B | 湘潭大学 | |
| B | 太原理工大学 | |
| B | 青岛大学 | |
| B | 云南大学 | |
| B | 温州医科大学 | |
| B | 河南大学 | |
| B | 青岛科技大学 | |
| B | 上海理工大学 |