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下面是南开大学化学学院科研机构:
国家重点实验室
元素有机化学国家重点实验室、药物化学生物学国家重点实验室
国家工程研究中心
农药国家工程研究中心
教育部重点实验室
功能高分子材料教育部重点实验室、先进能源材料化学教育部重点实验室
教育部工程研究中心
高效储能教育部工程研究中心
金属与分子基材料化学天津市重点实验室、新型储能材料天津市重点实验室
天津大学化工学院共同筹建了“天津化学化工协同创新中心”。
此外,南开化学拥有1个国家基础科学研究和教学人才培养基地、1个国家实验教学示范中心。