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中国科学院数学与系统科学研究院成立于 1998 年 12 月，由中科院数学研究所、应用数学研究所、系统科学研究所和计算数学与科学工程计算研究所等四个研究所整合而成。研究院是一个综合性的国立学术研究机构，研究领域覆盖了数学与系统科学的主要方向。数学与系统科学研究院是中国科学院的一个博士生重点培养基地，所属的四个研究所是我国最早被批准具有硕士、博士学位授予权的单位之一，是首批国家批准的博士后流动站之一。全院共有 12 个博士点（二级学科）分布在数学、系统科学、计算机科学与技术、管理科学与工程四个一级学科中，具有“数学”、“系统科学”、“管理科学与工程”一级学科的学位授予权；“计算机软件与理论”二级学科的学位授予权，可以在此范围内招收和培养硕士研究生与博士研究生。在 2006 年全国学科评估中，我院数学学科的整体评估得分为本学科的最高分数。
研究生院数学科学学院是在原中国科学院研究生院数学系的基础上，由研究生院和中国科学院数学与系统科学研究院联合组建成立，院长和副院长分别由数学与系统科学研究院的院长和分管教育的副院长担任，她是科学院数学相关学科研究生培养的平台，由数学与系统科学研究院的四个研究所和数学系共同组成，集成了研究生院、数学与系统科学研究院的综合优势，数学科学学院研究生课程体系规范、科研环境优良，拥有一支教学与科研相结合的高水平的师资队伍，并由国内外知名的专家、学者担任授课教师，其中专任教师队伍中有教授 10 人、副教授 5 人、博士生导师 8 人、 硕士生导师 14 人、中国科学院“百人计划” 入选者 1 人。
自 2009 年起，研究生院数学科学学院、数学与系统科学研究院联合招收研究生实验班。实验班导师由数学与系统科学研究院导师和研究生院数学科学学院专任教师共同组成。报考时只确定学科专业，不确定导师，入学后由导师和学生双向选择后再确定导师。实验班只招收推荐免试生。
一、培养目标：
拥护中国共产党的领导，拥护社会主义制度，为社会主义建设服务，在本学科掌握坚实的基础理论和系统的专门知识，具有从事科学研究、教学、管理或独立担负技术工作能力和创新精神的高级专门人才。
二、招生计划： 20 年计划招收约 140 名攻读硕士学位研究生（含推荐免试生），包括硕博连读研究生在内。
三、报考条件：
1 ．拥护中国共产党的领导，愿为社会主义现代化建设服务，品德良好，遵纪守法；
2 ．考生的学历必须符合下列条件之一： 
　　（ 1 ）国家承认学历的应届本科毕业生； 
　　（ 2 ）具有国家承认的大学本科毕业学历的人员； 
　　（ 3 ）获得国家承认的大专毕业学历后经两年或两年以上，达到与大学本科毕业生同等学力的人员；
3 ．身体健康状况符合规定的体检标准；
4 ．我院接收经教育部批准、具有推荐免试资格的高等学校的优秀应届本科毕业生免试为硕士生或硕博连读研究生。每年大约 8-10 月份，申请者递交申请，按规定时间参加复试，并在国家规定的报名时间内到报考点办理报名手续（具体办法见网上通知）。
四、报名手续：
报考硕士生全国进行网上报名。由中国科学院研究生院统一进行，研究生院的网址为 www.gscas.ac.cn ，咨询电话： 010-82682512 。
相关信息查询网址：
http://admission.gucas.ac.cn/index.asp ， www.amss.ac.cn
报考人员在规定日期内到报名点交验报考有关证明材料，交纳报考费，领取有关表格。报考登记表由报考点或考生本人在规定日期寄到我院招生办公室，审查合格后，发准考证。
五、考试：
1. 入学考试分初试和复试。 
2. 初试日期：（具体时间见准考证）。 
3. 初试科目：政治理论，英语和二门专业课。各科考试时间为 3 小时，其中政治理论课、英语的满分值为 100 分，二门专业课的满分值各为 150 分。 
4. 政治理论、英语、数学 ( 一 ) 和数学 ( 三 ) ，由教育部统一命题，考试大纲由教育部制订；其他科目由我院自行组织命题，考试科目及参考书可上网查询。 
5. 初试地点：考生到本人所在的省（区、市）高校招生办公室指定的考场应试。
6. 复试内容、时间、地点、方式等由我院招生领导小组和各复试小组根据各专业的培养要求，结合其他知识和能力的考核来定，具体要求见网上通知。 
7. 对以同等学力资格报考的考生，要全面、严格复试。要对其进行本科主干课程和实验技能的考查，其中笔试科目不少于二门，每门考试时间为 3 小时。
六、体格检查： 考生复试时到指定医院或体检中心进行体格检查，必须做肝功能检查并附化验单。
七、录取： 根据考生考试成绩（含初试和复试），并结合其平时学习成绩和思想政治表现、业务素质以及身体健康状况，择优录取。
八、学习年限： 硕士生学习年限一般为 2 年半至 3 年。
九、毕业生就业： 根据国家建设需要和学以致用的原则采取毕业研究生与用人单位在国家规定的服务范围内“双向选择”的方式，落实就业去向。